STEP 01
Shopify Paymentsと外部決済の範囲を分ける
Shopify PaymentsはShopify管理画面で設定し、対応するカードや迅速なチェックアウトをストアのチェックアウトで受け付ける決済サービスです。外部決済サービスを併用する場合は、各社の決済手数料、Shopify側の外部サービス取引手数料、入金、返金窓口を別々に確認します。
STEP 02
決済費用を注文単位で記録する
Shopify Paymentsのカード手数料はプランや決済条件で変わるため、2026年9月2日時点の日本向け公式料金ページと契約画面で確認します。Shopify Paymentsを利用する取引と外部決済の取引を分け、売上、決済方法、処理手数料、通貨、税、返金後の費用を注文IDへ結びます。
STEP 03
日本の入金日を営業日で見積もる
2026年9月2日確認時点で、日本のShopify Paymentsは日次支払いを利用できず、週単位または月単位のスケジュールを選びます。公式案内では決済期間は5営業日に支払日までの残り日数を加え、送金後に銀行側の処理時間がかかる場合があります。注文日だけで資金繰りを組まず、管理画面の支払い予定と銀行着金を照合します。
STEP 04
返金は売上取消と費用を分ける
Shopify Paymentsの返金額は次回の支払い可能額から差し引かれます。返金開始後は取り消せず、元のクレジットカード処理手数料は返金されないと公式に案内されています。返品日、返金実行日、顧客への着金日、在庫補充、送料負担を別々に記録します。
STEP 05
チャージバックを通常返金と混同しない
チャージバックはカード所有者が銀行へ異議を申し立てる手続きで、通常の返品返金とは異なります。日本のShopify Paymentsでは、2026年9月2日確認時点の公式案内でチャージバック手数料は1,300円とされ、異議申し立てに勝った場合は手数料が返金されます。通知期限、証拠、対象金額、手数料、結果を案件単位で管理します。
STEP 06
注文・支払い・銀行入金を三点照合する
注文売上の合計と銀行着金だけを比べると、手数料、返金、チャージバック、保留、複数日の売上をまとめた支払いで差が出ます。注文ID、決済取引、Shopifyの支払い明細、銀行明細を月次で結び、未入金と時期差を分けます。会計では総売上と手数料を相殺せず、採用する記帳方法を税理士などへ確認します。